Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncQ9EPM5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms