Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn1Q9EPL2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms