Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms