Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms