Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms