Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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