Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd8Q9DA37 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms