Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bpifa3Q9D9J8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms