Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms