Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms