Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms