Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms