Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms