Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms