Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms