Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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