Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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