Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ccdc39Q9D5Y1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ccdc39Q9D5Y1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ccdc39Q9D5Y1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ccdc39Q9D5Y1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ccdc39Q9D5Y1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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