Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Zcchc13Q9D548 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Zcchc13Q9D548 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Zcchc13Q9D548 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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