Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms