Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms