Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms