Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms