Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig1Q9D2J4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms