Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms