Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyc1Q9D0M3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms