Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spc24Q9D083 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms