Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms