Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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