Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snf8Q9CZ28 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms