Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms