Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Xrcc3Q9CXE6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Xrcc3Q9CXE6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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