Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc17Q9CXD9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc17Q9CXD9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc17Q9CXD9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc17Q9CXD9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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Lrrc17Q9CXD9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Lrrc17Q9CXD9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Lrrc17Q9CXD9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc17Q9CXD9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms