Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms