Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms