Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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