Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms