Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms