Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prps2Q9CS42 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms