Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms