Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms