Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccer1Q9CQL2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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