Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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