Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nudt21Q9CQF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms