Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms