Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms