Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms