Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms