Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms