Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BrapQ99MP8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms